在巴西、中国和德国，每年都会制造成千上万的水晶头骨制品。但是，有几十个令人毛骨悚然的水晶头骨令考古学家、科学家、巫师以及博物馆官员为之着迷、为之争论了长达一百多年。
这十几个稀有的水晶头骨或者被私人收藏，或者保存在公共机构。有些水晶头骨晶莹剔透，其它水晶头骨或为烟水晶或为有色水晶。有些为真人头骨大小并且做工极其细致，另一些则相对较小并且做工略显粗糙。所有这些水晶头骨都被认为源于墨西哥和中美洲。许多人都相信这些水晶头骨是某个古代中美洲文明在上千年甚至上万年前所雕刻。还有的人认为这些水晶头骨是传说中亚特兰蒂斯岛的遗物，或者是外星人在西班牙入侵之前曾经光顾过阿兹特克的有力证据。
水晶头骨关于这些头骨的故事大多集中在它们感知的超自然力量。《Mysteries of the Crystal Skulls Revealed》（揭开水晶头骨的秘密）的联合作者乔叔华•夏皮罗(Joshua Shapiro)在他的网络上引述了这些水晶头骨的目击者的话——他们认为这些水晶头骨可以帮助治病并且增长了他们的通灵能力。“我们相信水晶头骨是计算机的一种形式，能够记录周围产生的能量和振动”，他写道，“这些头骨形象地再现了与其接触的人们的所有活动或者影像（即：它们储存了我们所在世界的历史）。”
亚利桑那州立大学人类学教授迈克尔•史密斯(Michael Smith)表示：“它们是繁衍的象征，这些头骨代表某些阿兹特克神，因此它们或许是用于向这些神祈祷。我不认为它们可能具有某种力量或者其它神奇之处。”
另外，英国博物馆和史密森学会利用电子显微镜对这些头骨进行的分析结果显示，有迹象证明这些头骨可能仅仅是现代人雕刻的艺术品。这两家博物馆估计自己收藏的这些头骨可以追溯到19世纪中叶或者晚期，这正是公众对古文化产生浓厚兴趣的时期，并且那时的博物馆也急于寻找古代文物进行展出。
